公司不批休假就按旷工扣工资是否合法，可依据《工资支付暂行规定》第十六条判断。该条款明确：“因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按劳动合同约定要求赔偿，赔偿可从工资中扣除，但每月扣除部分不得超过当月工资20%，扣除后剩余工资低于当地月最低工资标准的，按最低工资支付。”结合“公司不批休假视为旷工扣工资”的情况，若员工确因自身原因（如未依规申请休假擅自离岗）导致旷工，公司可按合同约定扣工资，但需满足两点：一是每月扣款不超过当月工资20%；二是扣除后工资不低于当地最低工资。若公司未满足上述条件，即便以“旷工”为由扣工资，也违反该规定，员工有权要求返还超额扣款或补足至最低工资标准。
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处理公司不批休假视为旷工扣工资的问题时，以下特殊情况或例外情形会影响处理结果：
1、员工有正当且紧急的休假事由（如突发疾病、直系亲属病危）。若员工在紧急情况下未按公司常规流程申请休假（如深夜突发急病需立即就医，无法提前书面申请），公司仍以“未批休假”视为旷工扣工资，处理结果会受影响。此时员工休假行为具有合理性，公司应优先人性化处理，否则可能被认定为侵犯员工合法权益。
2、公司关于休假审批的规章制度本身不合法或不合理。例如规定“所有休假需提前30天申请，否则一律不批”，可能因限制过严侵犯员工即时休假权（如病假、婚假等需及时处理的情形）。在此情况下，即便员工未按此规定申请休假，公司以“不批休假”视为旷工扣工资，也可能因规章制度无效导致处理行为违法。
3、员工与公司就休假事宜存在口头约定或历史惯例。如果员工以往类似休假申请（如短期事假）未按书面流程但经领导口头批准，形成历史惯例，本次公司突然以“未书面批准”视为旷工扣工资，处理结果会受影响。此时员工可主张按惯例处理，公司单方面改变规则可能不具约束力。
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公司不批休假视为旷工扣工资是否合法，需结合具体情况判断。以下从不同情形详细分析：
- 若公司不批休假的理由不符合规章制度或法律规定，且员工已按要求提交休假申请（如提前通知、提供必要证明等），则视为旷工扣工资不合法。此时员工休假权受法律保护，公司无正当理由不予批准并按旷工处理，属于违法克扣工资。
- 若员工未按公司规定程序申请休假（如未提前通知、未提供病假证明等），公司不批休假后员工擅自离岗，公司将其视为旷工并按规定扣工资，在符合法定扣款标准的情况下是合法的。但需注意，即便员工存在程序瑕疵，公司也应先沟通提醒，而非直接按旷工重罚。
- 若公司规章制度中关于旷工扣工资的规定本身违反法律（如扣款超过当月工资20%或扣除后低于最低工资标准），即使公司不批休假理由正当，扣工资行为仍不合法。规章制度合法性是公司处理员工行为的前提。
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在公司不批休假视为旷工扣工资的问题中，员工常因错误操作导致权益受损，需特别注意以下行为：
1、未按规定提交休假申请：部分员工因急事直接离岗，未提前书面申请或未提供必要证明（如病假需医院证明），导致公司以“旷工”为由扣工资。即便休假理由正当，程序缺失也可能使自身处于不利地位。
2、忽视与公司的书面沟通：在休假申请未获批或对旷工认定有异议时，仅通过口头沟通，未保留书面异议记录（如邮件、书面说明等），一旦发生纠纷，难以证明自己曾提出异议，增加维权难度。
3、擅自以“扣工资违法”为由对抗公司：部分员工认为公司不批休假扣工资必然违法，于是拒绝履行工作义务或采取过激行为（如罢工、破坏公司财物），反而可能因违反公司规章制度被处罚，导致维权焦点转移。
若你已出现类似错误操作或对公司处理仍有疑问，可随时咨询我，我会为你提供专业解答，避免因不当应对扩大损失。

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